PROTEIN ENGINEERING

A.A. di erogazione 2020/2021
Insegnamento obbligatorio

 (A.A. 2019/2020)
Anno di corso: 
2
Tipologia di insegnamento: 
Caratterizzante
Settore disciplinare: 
BIOCHIMICA (BIO/10)
Crediti: 
6
Ciclo: 
Primo Semestre
Ore di attivita' frontale: 
48
Dettaglio ore: 
Lezione (48 ore)

Docente: Prof. Loredano Pollegioni
6 CFU ovvero 48 ore di lezioni frontali. Il programma è diviso in due parti che trattano i seguenti argomenti:
a) Rapporto struttura e funzione nelle proteine
- Introduzione alla struttura delle proteine; classificazione strutturale delle proteine
- La sintesi proteica: meccanismi e regolazione
- Metodi sperimentali e in silico di determinazione della struttura delle proteine
- Modifiche post-traduzionali e protein targeting
- Protein folding (in vitro e in vivo)
- Degradazione delle proteine (sistema lisosomiale e proteasomico)
- Proteine di membrana: rapporto struttura e funzione
b) Ingegneria Proteica:
- De novo protein design (di strutture e funzioni): metodi ed esempi
- Rational design: teoria e metodi sperimentali. Esempi
- Molecular docking: teoria ed esempi
- Irrational design: teoria e metodi sperimentali di directed evolution. Esempi
- Metodi di screening
- Ingegnerizzazione della stabilità delle proteine: teoria, metodi ed esempi.

Il modulo “Protein Engineering” consiste in 48 ore di lezioni frontali. Tutte le attività si svolgeranno in presenza del docente incaricato. Ogni lezione verrà svolta trattando un argomento specifico mediante l’ausilio di presentazioni powerpoint, disponibili in anticipo sulla piattaforma e-learning. Durante le lezioni verranno anche presentati casi di studio pubblicati in riviste scientifiche del campo, che verranno fornite come materiale didattico.

Slides delle lezioni: scaricabili dal sito e-learning
Testi consigliati:
Arnold F. H., Georgiou G. Directed Enzyme Evolution: Screening and Selection Methods (Methods in Molecular Biology) (Humana Press)
Arnold F. H., Georgiou G. Directed Evolution Library Creation: Methods and Protocols (Methods in Molecular Biology) (Humana Press)
Branden C. e Tooze J., Introduction to protein structure (Garland Publ.)
Bross P. e Gregersen N. Protein misfolding and disease, Methods in Molecular Biology, vol. 232 (Humana Press).
Garett-Grisham "Principi di Biochimica" (PICCIN)
Matthews, Van Holde, Ahern, “Biochimica” (Casa Editrice Ambrosiana)
Voet D, Voet JG, Pratt CW "Fondamenti di Biochimica" (Zanichelli)
Dal sito e-learning sarà scaricabile il materiale utilizzabile per completare la preparazione (articoli scien-tifici e review). Materiale aggiuntivo potrà essere richiesto al docente.

Ricevimento preferibilmente su appuntamento (mediante richiesta via e-mail). Il docente risponde solo alle e-mail firmate e provenienti dal dominio @uninsubria.it. Non si risponde a richieste di con-ferma di informazioni già disponibili - ad esempio richiesta della data appello di esame.
Il docente è disponibile ad incontri di approfondimento o discussione per gruppi di studenti.